Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms