Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcsQ9WU84 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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