Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema6cQ9WTM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms