Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma1Q9R1P4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms