Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb3Q9R1P1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms