Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zeb2Q9R0G7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zeb2Q9R0G7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zeb2Q9R0G7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms