Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms