Protein–RNA interactions for Protein: Q9R053

Scn11a, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn11aQ9R053 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn11aQ9R053 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn11aQ9R053 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms