Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Map1aQ9QYR6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Map1aQ9QYR6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms