Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn4Q9QXZ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn4Q9QXZ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms