Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChmQ9QXG2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms