Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcea2Q9QVN7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tcea2Q9QVN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms