Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMJ2

Fbxw4, F-box/WD repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw4Q9JMJ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxw4Q9JMJ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw4Q9JMJ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms