Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms