Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2bQ9JME9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms