Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap3b2Q9JME5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap3b2Q9JME5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms