Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rabgef1Q9JM13 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rabgef1Q9JM13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms