Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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