Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cabp1Q9JLK7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp1Q9JLK7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms