Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms