Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uchl3Q9JKB1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl3Q9JKB1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms