Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd3Q9JJY3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms