Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr12Q9JJA4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Wdr12Q9JJA4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms