Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RprmQ9JJ72 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RprmQ9JJ72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms