Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip1Q9JJ57 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip1Q9JJ57 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms