Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tulp4Q9JIL5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms