Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHG6

Rcan1, Calcipressin-1, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan1Q9JHG6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan1Q9JHG6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcan1Q9JHG6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms