Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf13bQ9ET35 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13bQ9ET35 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13bQ9ET35 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13bQ9ET35 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tnfrsf13bQ9ET35 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf13bQ9ET35 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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