Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clstn2Q9ER65 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms