Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef4Q9EQZ6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef4Q9EQZ6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms