Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sil1Q9EPK6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sil1Q9EPK6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sil1Q9EPK6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms