Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc38a3Q9DCP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc38a3Q9DCP2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms