Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3fQ9DCH4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms