Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop5Q9DB28 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms