Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4bQ9D8B3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms