Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arpc5lQ9D898 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arpc5lQ9D898 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms