Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2dQ9D7M8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2dQ9D7M8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2dQ9D7M8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms