Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4cQ9D7F7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms