Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4aQ9D6F9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms