Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4f1Q9D5Q6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms