Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn11Q9D572 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn11Q9D572 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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