Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc130Q9D516 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms