Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al3Q9D4U4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms