Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933421I07RikQ9D420 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933421I07RikQ9D420 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms