Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms