Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy3Q9D394 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rufy3Q9D394 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy3Q9D394 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms