Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rtl8bQ9D1F0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl8bQ9D1F0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms