Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms