Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arv1Q9D0U9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arv1Q9D0U9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms