Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed3Q9D0L1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbed3Q9D0L1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbed3Q9D0L1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms